Sông có các tên gọi địa phương khác nhau. Đoạn đầu nguồn sông khởi nguồn 21°56′45″B 106°02′27″Đ / 21,945969°B 106,040831°Đ / 21.945969; 106.040831 (Sông Thượng Nung B) từ phần đông bắc xã Sảng Mộc, có tên là Huổi Tát (nhiều văn liệu viết nhầm là huổi Tác), chảy về hướng tây nam.

Từ xã Thượng Nung sông có tên là "Sông Thượng Nung", được coi là tên chính thức, được nêu trong các bản đồ và danh mục sông.

Sang xã Thần Xa sông đổi hướng tây. Sông chảy đến Làng Đạt xã Văn Lăng huyện Đồng Hỷ thì đổ vào sông Cầu. 21°47′29″B 105°51′08″Đ / 21,791313°B 105,852246°Đ / 21.791313; 105.852246 (Sông Thượng Nung E)